靶點篩選

CRISPR/Cas9系統是當今基因編輯領域最熱門的明星工具,2013年,Broad研究所的兩個研究團隊分別在Science雜志同一期上發表了CRISPR文庫的相關研究。在此之后,基于CRISPR/Cas9的工具得到了快速發展,CRISPRa,CRISPRi及CRISPR敲除文庫已經廣泛用于證明新的生物學機制,如耐藥性和細胞存活信號。多篇CNS(Cell、Nature、Science)連續報道。利用該技術,研究人員在藥物靶標發現、基因功能研究、藥物敏感基因研究等領域取得了巨大的成功。

1. HYY現有CRISPR篩選文庫
文庫類型 文庫簡介 價格
人源lncRNA 激活庫 Human CRISPR lncRNA Activation Pooled Library (SAM-3)

靶向激活10,504個lncRNA
包含96,458個sgRNA靶點

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人源敲除庫 Human CRISPR Knockout Pooled Library (GeCKO v2)?

靶向敲除19,050個mRNA 及1864個miRNA
包含123,411個sgRNA靶點

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人源激活庫 Human CRISPR Activation Library (SAM-2)

靶向激活23,430個mRNA
包含70,290個sgRNA靶點

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小鼠敲除庫 Mouse CRISPR Knockout Pooled Library (GeCKO v2)

靶向敲除20,611個mRNA 及1175個miRNA
包含130,209個sgRNA靶點

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小鼠激活庫 Mouse CRISPRa sgRNA library Caprano (P65-HSF)

靶向激活22,774 (Set A), 22,658 (Set B) 個mRNA
包含134,076個sgRNA靶點

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其他 個性化定制 CRISPR/cas9 慢病毒文庫

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2.藥物靶標發現案例

Molecular Cancer(If 7.776)雜志8月份在線發表了廣州市第一人民醫院的文章,伊馬替尼(格列衛)是一種治療白血病及胃腸道間質腫瘤的藥物,但往往產生耐藥,機制不明。在該研究中,研究人員運用CRISPR/Cas9全基因敲除文庫在胃間質瘤中篩選并驗證了9個可能參與伊馬替尼耐藥的基因,可以用于深入探討伊馬替尼耐藥的分子機制。

篩選”耐藥基因的思路
耐藥基因篩選、差異基因的通路富集分析
耐藥基因功能驗證
Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in gastrointestinal stromal tumor ?with Imatinib resistance. Molecular Cancer. 2018; 17(1):121-127.
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